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寧陜齒突蟾和六盤齒突蟾線粒體基因組比較及中蛙亞目系統發育研究

媒體:陜西師范大學  作者:內詳   專業號:六盤齒突蟾 2022-03-26 17:47:38

無尾目(Anura)是脊椎動物兩棲類一個較大的研究較深入的類群,目前GenBank已收錄超過200種無尾目線粒體基因序列.中蛙亞目(Mesobatrachia)是無尾目中一個類群,物種種類眾多,多樣性強,但目前僅有21種物種的線粒體基因組被報道,研究尚不完善.齒突蟾屬(Scutiger)作為中蛙亞目中一個重要的分類單元,包含物種多為稀有瀕危種類,然而缺乏線粒體全基因組序列報導,對該屬的分類研究造成許多困擾.基于此,本研究對齒突蟾屬的物種寧陜齒突蟾(Scutiger ningshanensis)和六盤齒突蟾(Scutiger liupanensis)進行線粒體基因組測序并分析,以期為齒突蟾屬及相關物種的分類學研究進一步提供分子研究證據.研究采用PCR技術,結合引物步移法及基因組步移法進行產物測序,利用生物信息學手段對測得的片段進行拼接,注釋和分析,結合NCBI數據庫中已收錄的21種中蛙亞目線粒體基因組序列信息,分別以PCGs,rRNAs,rRNAs PCGs為數據集,以新蛙亞目的中國林蛙(Rana chensinensis)以及中國雨蛙(Hyla chinensis)為外群,采用最大簡約法(Maximum Parsimony, MP),最大似然法(Maximum Likehood, ML)和貝葉斯推論法(Bayesian Inference, BI)構建系統發育樹,進行中蛙亞目各物種的系統發育關系的分析.

本文來自[1]范瑞娜. 寧陜齒突蟾和六盤齒突蟾線粒體基因組比較及中蛙亞目系統發育研究[D]. 陜西師范大學, 2016.的摘要部分。

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