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極小種群野生植物保護與利用創新團隊成功解析茶果樟的全基因組
茶果樟(Cinnamomum chago B.S. Sun et H.L. Zhao)是受國家II級重點保護的極小種群野生植物，僅分布于云南省漾濞縣和云龍縣等地。茶果樟的果實被當地人稱為“茶果”，具有清熱明目功效，常炒熟后在市場上售賣，是深受當地人喜愛的“堅果”，有悠久的利用歷史。研究還顯示，茶果樟的果實含有大量月桂酸和癸酸，具有工業利用潛力;其樹形優美，木材質地堅硬、有香味，是極具開發前景的園林綠化和材用樹種。此外，《中國植物志》將中國樟屬植物分為樟組(Sect. Camphora)和肉桂組(Sect. Cinnamomum)，茶果樟形態、解剖和分子都介于樟組和肉桂組之間，其系統發育位置特殊，具有重要的科學研究價值。
近日，為開展茶果樟遺傳資源的精準保護和特色資源的發掘利用，依托中國科學院昆明植物研究所的云南省極小種群野生植物保護與利用創新團隊基于HiFi三代測序、全基因組和轉錄組ONT測序、Hi-C、二代全基因組和二代轉錄組測序等技術，對茶果樟進行了測序、組裝和注釋，獲得染色體水平高質量全基因組。其基因組大小為1.06Gb，contig N50長度92.10Mb，約99.92%的組裝序列可以定位到12條染色體上(2n=24)，組裝結果僅1個gap，同時共注釋發現30497個基因，其中28681個基因為蛋白質編碼基因。
基于本研究結果，團隊在國際期刊Scientific Data在線發表了題為 “Chromosome-level genome assembly of the threatened resource plant Cinnamomum chago”的研究論文，團隊博士研究生陶麗丹和郭世偉為共同第一作者，孫衛邦研究員為論文的通訊作者。本研究獲得第二次青藏高原綜合科學考察研究項目(2019QZKK0502)、云南省野生動植物保護項目(2021SJ14X-10)和國家科技基礎資源調查專項項目(2017FY100100)的資助。
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