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中國科學院微生物所尹文兵研究團隊揭示RNA結合蛋白復合體轉錄后調控真菌次級代謝的新機制
2023年11月14日，中科院微生物研究所尹文兵研究團隊在Nature Communications上發表題為“Fungal secondary metabolism is governed by an RNA-binding protein CsdA/RsdA complex” 的研究論文。該研究揭示了RNA結合蛋白與全局調控因子RsdA形成復合體，并在轉錄后水平控制其表達，介導真菌全局次級代謝變化的新機制，對深入理解真菌次級代謝調控的機制及新穎次級代謝產物的發現具有重要意義。
本研究從絲狀真菌中鑒定到一個全新的調控真菌次級代謝的RNA結合蛋白CsdA。為研究其調控機制，研究團隊通過遺傳敲除、轉錄組學和代謝組學分析，發現CsdA和全局調控因子RsdA能夠協同調控真菌的次級代謝。在機制上，揭示了RNA結合蛋白通過與RsdA形成核內復合體，并在轉錄后水平調控其pre-mRNA剪接從而協調真菌次級代謝的新模式。這種轉錄和轉錄后交叉調控的新模式不僅有助于理解復雜的真菌次級代謝調控網絡，還為新天然產物挖掘提供了新策略。
圖1 RNA結合蛋白CsdA與RsdA協同調控真菌發育和全局性代謝變化
圖2 CsdA與RsdA互作并在轉錄后水平控制其表達以協調真菌次級代謝的機制
中國科學院微生物研究所博士生宋自力為該論文第一作者，尹文兵研究員為該論文通訊作者。此外，中國科學院微生物研究所劉曉研究員、美國威斯康辛大學麥迪遜分校的Nancy Keller教授和堪薩斯大學的Berl Oakley教授等專家為本研究提供了大力支持。本研究得到了國家重點研發計劃、國家自然科學基金、中國科學院基礎前沿科學研究計劃、中國科學院基礎前沿科學研究計劃從0到1原始創新項目和中國科學院戰略生物資源計劃等項目的支持。
原文鏈接：https://www.nature.com/articles/s41467-023-43205-2
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