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漾濞槭全基因組獲解析
媒體:科技日報 作者:趙漢斌
專業號:生物多多
2019-08-07 18:17:35
漾濞槭原產于云南蒼山西面的漾濞山谷,屬于槭樹科的楓屬植物。此屬植物在產糖、用材和觀賞方面都具有重要的價值,同時因其種群規模小、繁殖不良和棲息地退化面臨極高的滅絕風險而備受關注。記者近日從中科院昆明植物研究所獲悉,該所近期已成功解析這個極小種群野生植物的全基因組。相關論文發表在國際期刊《GigaScience》上。
自2003年被發現以來,中科院昆明植物研究所極小種群野生植物綜合保護團隊持續開展研究工作,明確了其野外種群數量、傳粉生物學與種子散布特征,以及物種遺傳樣性與種群結構。今年以來,團隊又完成了漾濞槭全基因組測序、組裝,獲得了近于染色體水平的高質量全基因組,也是目前首例槭樹科植物的全基因組報道。
有意思的是,通過與葡萄的全基因組共線性分析顯示,與葡萄染色體相比,漾濞槭染色體中保留了大量祖先染色體成分,其地位或可替代葡萄成為無患子目染色體進化分析最重要的參考基因組。
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